雷克萨斯CT200h的变速箱挡把很小巧，它共有B、D、N、R四个挡位，并带有自动归位功能，就是说无论你切换至那个挡位，挡把始终在同一位置。结合P挡位按键，变速箱共有5种模式。而B挡是比较特别的一个挡位，它是带有辅助刹车功能的前进挡，用在车辆下陡坡的时候。在一般路况行驶时，挡位放回至D挡即可。CT200h变速箱挡位的操作方式与新普锐斯相同。